Новое исследование для пациентов с колоректальным раком

Caris Life Sciences® представляет результаты, которые обеспечивают более глубокое понимание того, что экспрессия генов в опухоли, связанная со степенью воздействия лекарственного средства, стратифицированная по статусу p53, связана с клиническими результатами обычных химиотерапевтических схем, используемых для лечения метастатического колоректального рака (CRC). Эти результаты будут представлены на ежегодном собрании Американской ассоциации исследований рака (AACR) 2022 года, которое пройдет с 8 по 13 апреля 2022 года в Новом Орлеане, штат Луизиана.

Исследование с постером под названием «Прогностические и прогностические сигнатуры генов, индуцированных лекарствами, у пациентов с колоректальным раком, персонализированные на основе статуса p53 и лечения FOLFOX, 5-FU, оксалиплатином или иринотеканом» (Аннотация № 1231), было проведено под руководством Вафика Эль-Дейри. , MD, Ph.D., FACP, директор Онкологического центра Легоррета Университета Брауна, заместитель декана Медицинской школы Уоррена Альперта, член Caris' Precision Oncology Alliance (POA). Caris' POA — это растущая сеть ведущих онкологических центров по всему миру, которые сотрудничают для продвижения прецизионной онкологии и исследований на основе биомаркеров. Эта работа представлена ​​​​в Новом Орлеане Линдси Карлсен, аспирантом патобиологии в лаборатории EL-DEIRY в Брауне.

Цель этого исследования состояла в том, чтобы определить прогностические биомаркеры для химиотерапии, используемой при колоректальном раке. В исследовании использовались клеточные линии CRC для идентификации дифференциально экспрессируемых генов после лечения 5-фторурацилом, иринотеканом или оксалиплатином, и стратификация сигнатур на основе статуса p53. На основе этих исследований in vitro исследователи затем изучили, могут ли эти гены и генные сигнатуры предсказать результаты лечения пациентов с колоректальным раком после химиотерапии (FOLFOX, 5-фторурацил, иринотекан или оксалиплатин). 2,983 образца пациентов с КРР дикого типа и 6,229 образцов p53 с потерей функции были проанализированы с помощью секвенирования ДНК/РНК нового поколения в Caris Life Sciences. Реальные результаты выживания были выведены из данных о страховых выплатах и ​​оценок Каплана-Мейера. Как прогностическая, так и непрогностическая экспрессия генов оказала значительное влияние на результаты выживаемости после специфического лекарственного лечения.

«Это исследование помогает нам понять важность генных сигнатур для демонстрации повышенной предсказательной способности по сравнению с отдельными транскриптами», — сказал Эль-Дейри. «Объединяя фундаментальные и клинические исследования, это исследование позволяет нам лучше понять, какие методы лечения с большей вероятностью принесут пользу пациентам с КРР». Исследование показало, что опухолевая экспрессия генов, связанных с воздействием лекарств, может предсказывать результаты после химиотерапевтического лечения:

• Высокий уровень мРНК EGR1 и FOS независимо предсказывает реакцию на FOLFOX у пациентов с опухолями p53 дикого типа.

• Низкий уровень мРНК CCNB1 коррелирует с хорошим прогнозом у пациентов с CRC с опухолями, содержащими мутации потери функции TP53.

• Низкая экспрессия BTG2 предсказывает лучший прогноз у пациентов с опухолями с мутацией MSI-High TP53.

• Генные сигнатуры могут демонстрировать повышенную прогностическую способность по сравнению с эффектами отдельных транскриптов.

«Caris сосредоточена на биомаркерах, которые могут предсказать реакцию пациента на новейшие методы лечения, а также на проверенные и настоящие химиотерапевтические препараты, такие как FOLFOX», — сказал В. Майкл Корн, доктор медицинских наук, главный медицинский директор Caris. «Мы рады видеть, что возможности трансляционных исследований подкреплены огромными мультиомными данными и аналитическими инструментами, которые Caris разработала и продолжает совершенствовать».

Комплексное молекулярное профилирование Caris оценивает экспрессию всего экзома (ДНК), всего транскриптома (РНК) и белка, предоставляя непревзойденный ресурс и идеальный путь для проведения трансляционных исследований для ускорения обнаружения, диагностики, мониторинга, выбора терапии и разработки лекарств. для улучшения состояния человека.

Кэрис представит дополнительные данные исследований, демонстрирующих решающую роль точной медицины и молекулярного профилирования в лечении рака. Все презентации будут доступны онлайн на веб-сайте Caris с 8 апреля 2022 года.

Дополнительные презентации раскрывают влияние комплексного молекулярного профилирования и потенциальную клиническую действенность

• Всесторонняя характеристика изменений FGF/FGFR при инвазивном раке молочной железы (Абстракт № 5793). Передача сигналов FGFR является центральной для пролиферации, миграции, ангиогенеза и выживания раковых клеток; Изменения FGFR стали клинически действенными при увеличении числа типов рака. В этом исследовании оценивалась частота и характеристика многочисленных изменений FGF/FGFR в более чем 12,000 XNUMX инвазивных раков молочной железы и подчеркивалась огромная гетерогенность изменений FGF/FGFR в различных гистологических и молекулярных подтипах, а также в различных метастатических участках рака молочной железы. Кроме того, ассоциации изменений FGFR и резистентности к терапии были показаны в большой клинической базе данных с соответствующими молекулярными результатами.

• Геномные и иммунные характеристики подтипов EGFR при немелкоклеточном раке легкого (НМРЛ) (Абстракт № 4119) Хотя опухоли НМРЛ с мутациями EGFR обычно устойчивы к ингибиторам PD-1/PD-L1, у небольшой группы пациентов может наблюдаться стойкий ответ . Опухоли с мутациями EGFR демонстрируют значительную молекулярную гетерогенность, однако отсутствует ясность в отношении геномных и иммунных профилей подтипов мутаций EGFR, и дальнейшее выяснение этого может помочь в выявлении пациентов, которые могут ответить на иммунную терапию. Используя мультиомные молекулярные данные, полученные с помощью секвенирования ДНК и РНК следующего поколения в большой когорте опухолей НМРЛ, это исследование подтверждает снижение иммуногенности, связанное с большинством подтипов мутаций EGFR, проявляющихся биомаркерами, включая PD-L1, TMB и CD8+ T. клеточная инфильтрация; и выявляет редкие мутации EGFR, связанные с благоприятным иммунным профилем, которые могут свидетельствовать о реакции на иммунную терапию.